050.武汉生物制品研究所有限责任公司NGS项目--招标公告

国药中生武招字第（2024）050号

1.目的

为保证高通量测序（NGS）平台运行，服务各科室，**公司拟采购高通量测序分析系统（转录组平台搭建、细菌/病毒基因组平台搭建、宏基因组数据平台搭建、宏基因组医学平台搭建）。通过本次招标选择一家符合资质、专业性强、有丰富高通量测序（NGS****公司提供服务。

2.范围

高通量测序（NGS）分析系统包含：1、转录组平台搭建、细菌/病毒基因组平台搭建、宏基因组数据平台搭建、宏基因组医学平台搭建。2、对人员进行平台使用和生物信息学的培训。

3.投标单位资格

3.1投标****商行****机关登记取得合格有效的营业执照，具有中华人民**国独立法人资格；

3.2投标单位必须有相应高通量测序（NGS）相关资质，在行业主管部门备案且处于有效期内；投标单位的投标人非法人的，应出具本单位出具的法人代表授权委托书；

3.3投标****公司规模、人员配备及人员专业性的内容。

3.4投标单位应出具企业高通量测序（NGS）分析能力过往项目业绩证明，数量不少于3个（提供合同协议书）。

上述资料均需加盖公章，否则视为无效投标。

4.服务地点

****工业园路1号****。

5.服务时间

2025年1月1日-2028年1月1日

6.工作内容及要求

投标方在投标前务必详细了解用户需求并到现场实地考察服务器，否则由此造成的一切后果均由投标方自行承担。

6.1工作内容

所购高通量测序（NGS）分析系统承担转录组平台、细菌/病毒基因组平台、宏基因组数据平台、宏基因组医学平台的搭建，为期不少于3年的免费售后服务（包括软件系统升级），期间提供甲方免费上门学习生物信息的知识，及对人员进行平台使用的培训。如果搭建的分析流程不能满足甲方分析的需求，乙方需每年提供不超过5次分析的服务。

6.1.1转录组平台搭建的内容

（1）样本的相关性分析

（2）样本的主成分分析

（3）差异基因筛选、差异基因箱图

（4）差异基因火山图

（5）差异基因的聚类热图

（6）差异基因韦恩图

（7）差异基因功能富集（GO和KEGG富集分析）

（8）基因结构分析（做成勾选项目）：新转录本位点分析、UTR分析、AS分析、SNP与INDEL分析

备注：需添加转录组子绘图功能

6.1.2细菌/病毒基因组平台搭建的内容

组装出单物种的基因序列：基因组组装、序列比对、变异位点检测（突变位点、氨基酸的情况以及整体的突变频率图）

常规的分析：基因结构注释和预测、蛋白功能注释和预测（COG聚类图、KEGG聚类图、GO聚类图）、基因组圈图

6.1.3宏基因组数据平台搭建的内容

基因预测：基因预测基本统计、基因数目韦恩图分析、组间基因数目差异分析、基因多样性分析

物种注释：物种丰度概况（门、属、KRONA分析示例图）、物种相对丰度聚类热图、PCOA分析、样本聚类分析、组间物种差异分析（LEFSE判别分析）

功能注释：功能丰度概况、功能相对丰度聚类热图、功能丰度PCOA分析、基于功能丰度的样本聚类分析、代谢通路比较分析、组间功能差异分析、功能注释分析（注释比例统计、Uniprot注释、KEGGPathway分类、Refseq注释、Pfam结构域分类、COG 分类、TIGRFAMs注释、CAZy数据库注释、ARDB数据库注释、CARD数据库注释、VFDB数据库注释、病原宿主互作分析、细胞色素 P450注释、TCDB 转运蛋白分类注、）基因丰度估计、差异基因和富集分析（基因丰度整体情况 基因表达PCA图和Pearson相关性图、基因差异分析 差异基因火山图和差异基因KEGG富集气泡图、物种丰度表 门纲目属种、 多样性、Aplha稀释曲线、ANOSIM、PCA、PCoA permanova、差异物种分析、LEfSe多级物种差异判别分析）

备注：需添加宏基因组子绘图功能

6.1.4宏基因组医学平台搭建的内容

下机数据跟数据库进行比对，鉴定物种。

6.2 工作要求

6.2.1项目开展过程中，由投标方提供相关信息起草编写的高通量测序（NGS）分析系统方案。此类调整由投标方体现在终版方案和项目报****公司。

6.2.2中标人不得中途退标，中标通知书下达十日内，中标人必须与招标人依据招标文件的内容签订合同。否则，招标人有权另行确定中标人，并依照《中华人民**国招标投标法》进行处置，****公司黑名单，三****公司投标。合同签订后，本招标文件自然转为合同附件，与合同具有同等法律效力。

6.2.3投标单位应在规定时间完成所有工作，各项任务的完成节点以合同形式约定为准，如遇特殊情况，经双方协商后可顺延。

7.报价方式

7.1投标人应提交已标价的报价。

报价表由以下部分组成，分别为：高通量测序（NGS）分析系统搭建的费用，报价表应包括本次招标全部内容的各项价格，并最终形成总价，如有缺项或漏项，在项目实施过程中，招标人将不予支付，并认为此项费用包含在总价中。

7.2投标人在服务期间的所有人员的交通、住宿和伙食费应含在总价中，招标人不再额外支付。

7.3投标人所报的相应分项的价格在合同实施期间应保持不变，并不因劳务、材料、机械、运输等成本的价格以及税金等其它一切因素的变动而做任何调整。

8.特别说明

承诺无故拖延项目完成一天，扣除全部报价的0.5%作为违约金,拖延一周扣除全部报价的10%作为违约金,拖延15天扣除全部报价的20%作为违约金,30天解除合同，并承担赔付责任。

9. 报名方式

9.1报名截止日期： 2024年10月21日15点30

9.2报名资质：****公司营业执照（复印件加盖公章）、资质证书（复印件加盖公章）、相关业绩、法人委托书、代理人身份证。只接受网络邮箱报名，发邮件时在正文中填写清楚参与报名单位名称、报名事项及编号，联系人及联系方式。

9.3此项目评标标准是以低价优先原则做为商务部分评选基础，通过评委综合评选后确定中标推荐人。

9.4投标书需准备3份，一正二副，标书里需附有企业相关资质、业绩、报价和技术方案等资料，所有投标方制作标书中必须加入反商业贿赂承诺书。否则视为无效标书。（反商****公司官网首页右下角可下载）

9.1报名截止日期： 2024年10月21日15点30

9.2报名资质：****公司营业执照（复印件加盖公章）、资质证书（复印件加盖公章）、相关业绩、法人委托书、代理人身份证。只接受网络邮箱报名，发邮件时在正文中填写清楚参与报名单位名称、报名事项及编号，联系人及联系方式。

9.3此项目评标标准是以低价优先原则做为商务部分评选基础，通过评委综合评选后确定中标推荐人。

9.4投标书需准备3份，一正二副，标书里需附有企业相关资质、业绩、报价和技术方案等资料，所有投标方制作标书中必须加入反商业贿赂承诺书。否则视为无效标书。（反商****公司官网首页右下角可下载）

10发布人：****

10.1联系地址：****工业园路1****研究所有限责任

10.2联系人：汪 洋

联系电话：027-****7028

报名邮箱：****@sinopharm.com