玉米广泛靶向代谢组+转录组技术开发

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玉米广泛靶向代谢组+转录组技术开发

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更新时间:

2019年06月12日

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关键信息:

玉米靶向

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玉米广泛靶向代谢组+转录组技术开发

竞价公告(****)

开始时间：2019-06-12 16:47:49

采购单位：****	联系人：孙伟
E-mail：无	联系电话：188****5975
传真：无	联系手机：无
邮编：无	平台联系电话（异议）：020-**9972；**@qq.com
项目名称：玉米广泛靶向代谢组+转录组技术开发	竞价编号：****
采购类型：货物类	开始时间：2019-06-12 16:47:49
项目预算(元)：已隐藏	结束时间：2019-06-15 17:00:00

无

付款方式：验收合格后，15个工作日支付全部货款

报价方式：总价报价

送货区域： **省 **市 **区

送货地址：仲恺路501号

送货要求： 3

最少报价家数：3

1、确定中标单位后，3天内签订合同。2、本项目产品需符合国家“三包”标准。3、供应商总报价均含税价。

项目名称：玉米广泛靶向代谢组+转录组技术开发

序号产品名称品牌产品类别型号数量单位是否标配详情

1	玉米广泛靶向代谢组+转录组技术开发	详见规格要求	信息化设备	详见规格要求	30.00	个	否
规格配置：1．技术目标：基于AB SciexQTRAP LC-MS/MS检测平台，利用广泛靶向代谢组技术开发（玉米）物种广泛靶向代谢组检测方法。开发的代谢物包括氨基酸及其衍生物、核苷酸及其衍生物、糖类、脂肪酸、黄酮类、酚胺类、生物碱等。转录组测序：样品检测合格后，利用Illumina测序平台，PE150测序策略，构建普通转录组转录组文库进行建库测序，完成甲方委托的相应建库测序分析项目，每个转录组数据承诺6Gb clean data，在总数据量足够的情况下，每个样本数据量不低于目标数据量的95%，平均Q20≥85% ，平均Q30≥80%。 2．技术内容：基于得到的30个（玉米）物种广泛靶向代谢组代谢物定性和定量数据，利用自建代谢组学和代谢组+转录组联合分析开发流程开展代谢物的数据分析。开发广泛靶向代谢组信息分析内容如下： (1) 数据质控； (2) 样本中代谢物鉴定注释； (3) 样本中代谢物相对定量分析； (4) 所有样本代谢物PCA和聚类热图分析； (5) 重复相关性分析（有生物学重复）； (6) 差异代谢物分析（OPLS-DA、聚类）； (7) 差异代谢物KEGG通路富集分析；开发转录组信息分析内容如下：（1）对原始数据进行去除接头污染序列及低质量reads的处理；（2）测序评估（质量值分布统计，测序碱基质量控制，测序数据产出统计）；（3）与参考基因组比对（有参）；（4）de novo序列组装（无参）；（5）Unigenes功能注释（无参）；（6）基因表达定量；（7）重复相关性检测（有生物学重复）；（8）差异表达基因筛选；（9）差异表达基因聚类分析；（10）差异表达基因的功能注释及富集分析(两个或以上样品)：差异表达基因GO功能富集；差异表达基因COG分类；差异表达基因KEGG注释；差异表达基因KEGG通路富集分析；（11）转录因子分析（12）SNP分析（有参）；（13）新基因预测（有参）；（14）可变剪切预测（有参）；（15）CDS预测（无参）；（16）SSR引物标记开发（无参）；开发代谢组+转录组联合分析内容如下：（1）联合分析主成分分析；（2）差异代谢物与差异基因KEGG注释分析；（3）差异代谢物与差异基因KEGG富集分析；（4）差异代谢物与差异基因皮尔逊相关性分析（相关性网络图，相关性聚类热图，九象限图）。 3．技术方法和路线：开发（玉米）物种广泛靶向代谢组检测技术，获得代谢物定性定量数据，与转录组数据一起开展生物学信息学分析，结合表型数据创新性的开展代谢生物学研究方法。
售后服务：按行业标准提供服务